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WB常见问题分析

2023-08-03

 WB简介

蛋白印迹是通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,将不同分子量大小的蛋白分离并转移到杂交膜上,再通过一抗/二抗复合物对蛋白质进行检测的一种免疫生化技术。

 WB基本操作

提取标本蛋白并定量

凝胶电泳分离蛋白

转移蛋白质到杂交膜

收膜和封闭

孵育一抗

洗涤

孵育酶联物(二抗或者亲和素-HRPAP

洗涤

底物显色或曝光检测

结果分析

 

1.高背景

可能原因

验证或解决办法

膜污染

使用干净镊子,戴手套操作,避免污染

膜干燥

保证充分的反应液,避免出现干膜现象

封闭不完全

封闭液不合适

延长封闭时间

比较尝试不同封闭液

缓冲液污染

使用新配置的缓冲液

漂洗不完全

增加漂洗时间和缓冲液体积

抗体浓度过高

降低一抗、二抗浓度

抗体与阻断蛋白有交叉反应

选择无交叉反应的封闭液,洗涤液中加入Tween-20可以减少交叉反应

 

2.信号弱或无信号

可能原因

验证或解决办法

抗原量不足

增加上样量

蛋白质降解

重新制备样品

抗原被封闭液遮挡

优化封闭液,缩短封闭时间,减小封闭液中的蛋白浓度

样本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低

设置阳性对照。若靶蛋白含量低,可适当增加样本上样量

膜的错误选择

选择合适孔径的膜。>22KD 0.45um

                              <22KD 0.22um

转膜不完全

 

转膜后确定转膜效率,保证胶与膜充分结合,保证电极正确装配,控制转膜温度,优化转膜电流及时间

甲醇浓度过高

过高的甲醇浓度会导致蛋白质与SDS分离,从而沉淀在凝胶中。同时会使凝胶收缩或变硬,抑制高分子蛋白的转移。因此,要根据不同分子量选择合适的甲醇浓度

洗膜过度

缩短洗涤时间或减少洗涤次数

封闭过度

减少封闭剂的量或缩短封闭时间。更换不同封闭剂类型

一抗失效

选择在有效期内的抗体,抗体避免反复冻融。选择现配现用的工作液

一抗反应不充分

增加抗体浓度,延长孵育时间

试剂之间不匹配

一抗与组织种属,一抗与二抗或和底物与酶系统之间不匹配。通过设置内参可以验证二级检测系统的有效性

HRP 抑制

所有溶液和容器中避免含有叠氮化钠

酶和底物失效

直接将酶和底物进行混合,如果不显色说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物,使用新鲜底物

曝光时间过短

延长曝光时间

 

 3.非特异性条带

可能原因

验证或解决办法

蛋白上样量过大

降低样本上样量

蛋白降解

使用新鲜制备的样本,并使用蛋白抑制剂

细胞传代过多,导致蛋白变异

使用原代或传代少的细胞做对照

抗体浓度过高

降低抗体浓度

交叉反应

选择单克隆抗体或亲和纯化的抗体,保证抗体特异性

不同异构体的存在

有些来源于同一基因的蛋白有不同异构体,每个异构体蛋白大小都是不同的

二抗非特异性结合

增加二抗对照,选择其他二抗

底物太灵敏

选择合适底物

曝光时间过长

减少曝光时间

 

4.   条带位置不对

可能原因

验证或解决办法

二聚体或多聚体的存在

增加蛋白质变性过程及强度

蛋白修饰

如糖基化、磷酸化等修饰状态会导致蛋白分子量增加

 

 5.   条带内出现不显影圆点

可能原因

验证或解决办法

转膜过程有气泡

转膜时赶尽气泡

 

 6.   条带不完整

可能原因

验证或解决办法

底物孵育不均匀

均匀孵育底物

 

 7.   微笑条带

可能原因

验证或解决办法

电泳速度过快

减少电压等减慢电泳速度

电泳温度过高

在冷室或冰浴中进行电泳

 

 8.   反影(白色条带,黑色背景)

可能原因

验证或解决办法

HRP浓度过高

降低二抗浓度

 

 9.   背景有黑色斑点

可能原因

验证或解决办法

转膜时有气泡或抗体分布不均匀

尽量去除气泡,抗体孵育时保持摇动

封闭剂中有聚集体

使用前过滤封闭试剂

抗体与封闭剂反应

选择合适的封闭剂

HRP耦联二抗中有聚集体

过滤二抗试剂,去除聚集体

 

 10.Markera变黑

可能原因

验证或解决办法

抗体与marker蛋白反应

marker和样本之间空出一个孔不上样

 

WB实验的主要试剂

1WB实验膜

PVDF膜,硝酸纤维素膜或尼龙膜。

2.封闭试剂

BSA或脱脂奶粉。

3.蛋白Marker

主要目的是确定靶蛋白的分子量大小;使用预染Marker还可以实时检测电泳分离情况并可以转移到膜上。

 4.蛋白提取及定量

类别

品名

SAB对应货号

 

蛋白提取

总蛋白提取试剂盒

PE001

核蛋白提取试剂盒

PE002

膜蛋白提取试剂盒

PE003

 

                     蛋白定量

BCA 蛋白定量试剂盒

PA001

Bradford 蛋白定量试剂盒

PA002

 5.一抗

*选择适合检测标本种属的一抗(说明书上有验证信息)

*选择适用于WB实验方法的一抗(说明书上有验证信息)

*选择单克隆抗体或经过亲和纯化的多克隆抗体

*根据说明书推荐的浓度优化最佳的抗体稀释比

6.内参

内参的作用:

1).检测整个WB实验过程及体系是否正常工作。

2).半定量的标准。

内参的选择:

一般为稳定表达的管家基因蛋白,来源最好选择和同时使用的一抗来源相同的,以方便二抗的选择。

内参选择: 

MW(kDa) 全细胞 线粒体 细胞核 细胞膜
   Vinculin(124kDa)    

NakATPase(112kDa)  

   

 

Lamin B1(66kDa) 

 
     HSP60(60kDa)    
  α-tubulin(55kDa)      
   β-tubulin(50kDa)      
   β-actin(43kDa)      
   GAPDH(37kDa)    TBP(38kDa)  
   

 VDAC1(30kDa)

 PCNA(29kDa)  
   Cofilin(20kDa)  COXIV(20kDa)    
     

 HistoneH3(15kDa)

 

 

 7.二抗

1).二抗的选择:

根据一抗来源种属及抗体lg亚型选择合适的二抗。

2).二抗的使用:

根据说明书推荐的浓度稀释二抗。

孵育条件一般为室温12小时。

 常用二抗

二抗名称

SAB对应货号

Goat anti-Rabbit lgG Secondary antibody HRP conjugated

L3012

Goat anti-Mouse IgG Secondary antibody HRP conjugated

L3032

Rabbit anti-Goat IgG Secondary antibody HRP conjugated

L3042

Goat anti-Rabbit lgG,FITC conjugated

L3202

Goat anti-Mouse lgG,FITC conjugated

L3302

 8.底物

A.显色底物:操作简便,灵敏度低,如TMBDABBCIPNBT

B.化学发光底物:灵敏度高,需要曝光检测设备(暗室、曝光设备和胶片)或者凝胶成像设备。

9.各种溶液

A.封闭液:一般为含有15BSA或者5%脱脂奶粉的PBSPBST0.1MPh7.4)或TBSTBST;也可以购买商业化的试剂。

B.稀释液:一般为封闭液或者单独的PBSTTBST,也可以购买商业化的试剂。

C.洗涤液:一般为PBSTTBST,也可以购买商业化的试剂。

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