针对不同样本类型的处理注意事项
一、细胞样本
贴壁细胞:弃去培养基,用PBS清洗2-3次。
悬浮细胞:将细胞悬液4℃离心,弃上清,收集细胞沉淀,向细胞沉淀中加入预冷的PBS,轻轻重悬细胞,再次离心,弃上清。重复2-3次以洗净培养基。收集细胞后,根据目标蛋白定位,选择合适的裂解液并提前添加蛋白酶抑制剂,防止蛋白降解。
➤ 总蛋白提取可选RIPA裂解液或使用试剂盒(#PE001)https://www.sabbiotech.cn/products/PE001
➤ 核蛋白提取推荐使用专门试剂盒(#PE002)https://www.sabbiotech.cn/products/PE002
➤ 膜蛋白需选用含强去垢剂(如SDS)的裂解液或试剂盒(#PE003)https://www.sabbiotech.cn/products/PE003
加入预冷裂解液,用移液器反复吹打,使裂解液与细胞充分混匀,在冰上裂解15-30min,贴壁细胞在裂解期间用刮刀把细胞刮下,反复吹打几次,悬浮细胞在裂解期间数次震荡,以助裂解充分,裂解后 4℃12000 rpm ,10-15min离心取上清。全程冰上操作,处理好的样本分装后低温保存,避免反复冻融。
二、组织样本
PBS冲洗组织去除多余的血液,称量组织并剪碎。加入一定比例预冷的裂解液和蛋白酶抑制剂,手工或使用匀浆器 / 破碎仪等将样本匀浆充分,可配合超声处理,提高蛋白得率,4℃12000rpm,15-20min离心收集上清并分装低温保存,避免反复冻融。
三、血清/血浆样本
血清处理:将血清在室温下凝固(不超过2h),4℃离心取上清并分装低温保存,避免反复冻融。
血浆处理:采血装入抗凝管,立即颠倒混匀,4℃离心取上清并分装低温保存,避免反复冻融。
样本处理小贴士
1. 处理样本时务必添加蛋白酶抑制剂,以防蛋白降解,若检测目标蛋白磷酸化状态,除蛋白酶抑制剂外还需添加磷酸酶抑制剂,以防目标蛋白去磷酸化。
2. 富含脂肪 / 油脂的样本去除油脂层后再取样;产生沉淀的样本,吸取上清,避免吸到沉淀造成WB拖带。
3. 膜蛋白本身蛋白丰度不高,提取后,可结合超声处理。取样加Loading buffer后不用煮沸,采用 50℃保温30分钟。Loading buffer中SDS终浓度含量可以提高至 3%-10%。若有些样品的膜蛋白含量太低,可以使用丙酮沉淀膜蛋白,再使膜蛋白溶解于上样缓冲液中,电泳时采用低电压低电流。
4. 粘稠或难溶样本(如核蛋白,富含核酸蛋白)。用强裂解液或可通过超声打断DNA,用注射器反复抽吸,适当延长煮沸时间等方式处理。
5. 血清 / 血浆样本中白蛋白与球蛋白占比较大,目的蛋白通常含量极低,不推荐选用这类样本做WB,也可将样本进行浓缩或去白蛋白和球蛋白处理。
针对不同分子量的蛋白跑胶及转膜条件
小分子蛋白(<30 kDa)
电泳:分离胶浓度15%或梯度胶,低压慢跑,观察marker位置,及时终止。
转膜:用0.22μm膜,恒流150-200mA,湿转30-60min。
中分子蛋白(30–100 kDa)
电泳:分离胶浓度10%-12%或梯度胶,正常电泳即可。
转膜:0.45μm膜,恒流200mA,湿转60-90min。
较大分子蛋白(100-200 kDa)
电泳:分离胶浓度8%或梯度胶,正常电泳即可。
转膜:0.45μm膜,恒流200mA,湿转1.5h-2h。
大分子蛋白(>200 kDa)
电泳:分离胶浓度6%或梯度胶,低压慢跑,注意温度。
转膜:0.45μm膜,恒流200mA,4℃过夜。
特殊分子量蛋白小贴士
1. 小分子蛋白转膜缓冲液中去除SDS;甲醇浓度20%-30%。
2. 大分子蛋白缓冲液里加入0.02%-0.1%的SDS;甲醇浓度<10%。
