Cy系列属于花菁类染料，其中Cy SE是非水溶性形式，Sulfo-Cy SE是磺酸化的高水溶性形式，两者属于单反应性染料，Sulfo-Cy bis-SE是磺酸化的高水溶双反应性染料；
一般水溶性Cy SE推荐做抗体标记，非水溶性推荐探针标记，注意无论是水溶性还是非水溶性Cy SE都是推荐使用有机溶剂DMSO进行溶解；
M代表甲基，E代表乙基，二者区别即分子量有所差异，对于探针标记客户需要额外注意；
该系列产品被广泛用于标记肽、蛋白质和寡聚体等生物分子，特别是精细蛋白和易于变性的蛋白。 Cy系列染料除了用于标记生物分子外，也常被用于动物活体成像。
由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段小，而近红外光在生物组织中的穿透深度较大，因此在检测复杂生物系统时，Cy系列染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时，Cy系列染料还拥有紫外光区染料和同位素标记无法具备的生物安全性，有利于在活生物体中监控各种标记分子的分布。
